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2005년~현재(용산 시기)
- 2000년대
- 2005. 08. 16.
- - 직제개정(교육문화교류단 신설 등 25명 증원)
- 2005. 10. 28.
- - 새 국립중앙박물관 신축 이전 개관(용산)
- 2006. 04. 06.
- - 직제개정(고객지원팀 신설)
- 2007. 05. 22.
- - 직제개정(아시아부ㆍ보존과학팀 신설, 교육홍보팀을 교육팀과
국제교류홍보팀으로 분리신설,소속박물관 관리과를 기획운영과로 변경)
- 2008. 03. 06.
- - 직제개정(박물관정책과를 기획총괄과로 변경)
- 2010년대
- 2010. 02. 11.
- - 직제개정(어린이박물관팀 신설, 사업기획팀과 국제교류홍보팀을
사업기획과와 국제교류홍보과로 변경)
- 2010. 12. 09.
- - 직제개정(연구기획부 신설, 고고부와 역사부를 통합하여 고고역사부 신설,
사업기획과. 전시팀. 교육팀을 문화사업과. 전시과. 교육과로 변경)
- 2012. 09. 07.
- - 직제개정(문화사업과와 국제교류홍보과를 통합하여 문화교류홍보과 신설)
- 2013. 09. 12.
- - 직제개정(디자인팀 신설)
- 2013. 11. 22.
- - 국립나주박물관 개관
- 2015. 07. 20.
- - 직제개정(어린이박물관팀을 어린이박물관과로 변경)
- 2015. 12. 30.
- - 직제개정(미륵사지유물전시관 신설)
- 2019. 02. 26.
- - 직제개정(미륵사지유물전시관을 익산박물관으로 개편)
- 2019. 05. 07.
- - 직제개정(기획총괄과와 연구기획부를 폐지하고 미래전략담당관과 박물관정보화과를 신설,
기획운영단을 행정운영단으로 변경)
- 2020년대
- 2020. 06. 09.
- - 직제개정(관리과, 아시아부를 시설관리과, 세계문화부로 변경)
- 2020. 12. 22.
- - 직제개정(박물관정보화과를 디지털박물관과로 변경)
